1909年設(shè)漠河總卡衙門，隸屬璦輝道。

1914年7月改設(shè)漠河設(shè)治局。

1917年1月改為漠河縣，為二等縣，屬黑河道。

1929年2月，撤銷道制，改由黑龍江省直轄。

1929年4月由二等縣升為一等縣，仍由黑龍江省管轄。

1934年，被劃歸偽黑河省管轄。

1945年抗日戰(zhàn)爭勝利后，隸屬黑龍江省。

1947年3月，撤銷漠河縣，并入呼瑪縣。

1981年5月設(shè)置漠河縣。

2018年6月撤銷漠河縣設(shè)立漠河市。

名稱沿用至今。